Зайдите в раздел Сайт - Редактор шаблонов - main.css - найдите:
.cartTable .inputText {text-align: center;font-size: 16px;max-height: 38px;max-width: 36px;border-color: #d9d9d9;padding: 0;}
замените на:
.cartTable .inputText {text-align: center;font-size: 16px;max-height: 38px;max-width: 36px;border-color: #d9d9d9;padding: 0;} .cartTable .cart-qty a {display: inline-block;vertical-align: middle;}