{% IF goods.attr.NAME_ID=SHOP_GOODS_MPN %}<g:mpn><![CDATA[{goods.attr.VALUE}]]></g:mpn>{% ENDIF %}
замените на:
{% IF goods.GOODS_MOD_ART_NUMBER %}<g:mpn><![CDATA[{goods.GOODS_MOD_ART_NUMBER}]]></g:mpn> {% ELSEIF goods.attr.NAME_ID=SHOP_GOODS_MPN %}<g:mpn><![CDATA[{goods.attr.VALUE}]]></g:mpn>{% ENDIF %}
Далее зайдите в карточку товара и проверьте, у всех ли модификаций задан Артикул. Если поля Артикула модификаций заполнены, то он указанные значения в данном поле будет выгружаться в Google.Merchant.
Также, стоит отметить для того чтобы каждая модификация товара выгружалась как отдельное товарное предложение, необходимо чтобы в Настройках выгрузки в поле Дополнительные настройки --> Шаблон названия товара была задана выгрузка Название товара (свойства модификации)